现在医学上，对于食管癌的手术治疗，虽然技术上在不断的改进，但是对于切除食管仍存在一定的风险，就目前来看，手术后的伤残率和病死率仍较高。最近一个调查反映伤残率和死亡率相当依赖于手术量、医院规模和肿瘤的分化程度。食管切除术及重建术后的并发症可分为术中和术后并发症。
　　术中并发症
　　术中并发症有心律失常、血压下降、出血、喉返神经损伤和支气管树损伤。喉返神经损伤－术中喉返神经损伤常发生在颈段食管切除术中，原因多为气管和甲状腺回缩，导致喉返神经的牵拉性损伤。胸内食管分离和淋巴结切除也会损伤这些神经。喉返神经的损伤率在经裂孔食管切除术估计为24%,而有报道在三区联合食管切除术中更高。喉返神经损伤将导致病人的咳嗽反射消失，可引起吸入性肺炎。
　　最近发展的食管癌扩大淋巴结清扫术中，如何清扫喉返神经区的淋巴结又保证不损伤神经是一个重要的手术难题。支气管树损伤－气管和主支气管常发生在气道膜部。气管损伤会导致气道憩室形成、吸入性肺炎或肺水肿，一般要求支架植入和手术修补。
　　术后并发症
　　术后并发症包括吻合口瘘，吻合口狭窄，乳糜胸，排空延迟，腹内脏器裂孔疝和反流性食管炎。
　　1、肺和胸膜的并发症－肺部并发症有肺膨胀不全，吸入性肺炎，胸腔积液和呼吸衰竭导致急性呼吸窘迫综合征。这些并发症是术后早期死亡的重要原因，在经胸食管切除术中的发生率高于经裂孔切除术。
　　2、胸腔积液多数原因是对侧胸廓的胸膜损伤引起气体和液体从手术区中流入胸膜腔中。这种积液可观察保守治疗和行胸腔穿刺或胸腔切开引流。
　　3、吻合口瘘－吻合口瘘是主要的食管切除术后的并发症之一。据报道发生率高达50%。以前，吻合口瘘的发生率相当高，但是最新数据显示现代的手术治疗引起的吻合口瘘导致死亡的几率仅有3.3%，并对远期预后无任何影响。吻合口可导致食管与相邻结构之间形成瘘道，如食管气管瘘，食管胸膜瘘，或食管皮下瘘。发生吻合口瘘的病人发生吻合口狭窄的几率也高，应考虑尽早行食管扩大术。
　　4、吻合口狭窄－吻合口狭窄发生在术后早期，原因是疤痕形成，若有吻合口瘘者发生率更高。但行气囊食管扩张术治疗者容易复发。在手术后期发生的吻合口狭窄者应定期进行内窥镜和CT检查。
　　5、乳糜胸－胸导管损伤会发生乳糜胸，见于各种手术方式。据报道经胸术较经裂孔术的发生率高。在术中，胸导管与肿瘤和附近的淋巴结一起切除，然后在切口位置上下方结扎胸导管残端。但是，一部分仍要求手术结扎胸导管，因为后者会提高死亡率。最近，有文献报道用明胶海面和螺圈经皮栓塞治疗乳糜胸的方法。
　　6、延迟排空－纵膈出现内大的气液平面是延迟排空的征像，即使病人无呕吐和不适症状。原因有缺乏幽门引流过程，裂孔处的梗阻，胸腔胃或结肠的过度扭转。排空延迟可用球囊扩张术并服用促蠕动的药物治疗。如果保守治疗失败，则要求再次手术并保证充分引流或重新放置胃管。